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& n# T+ S1 C2 M8 h3日破基因 3日尋快速診斷法
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迅速破解新型腸出血性大腸桿菌基因密碼的深圳華大基因研究院，全院有4000人員，有多達180部基因排序機，DNA排序能力是全球之冠。（李泉攝）
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V* ]2 n/ r8 @; X' x& [0 B9 |8 }7 `深圳華大基因研究院 解腸毒疫情主力成員
# \$ K1 _1 Q! Z3 e% }) Q公仔箱論壇【明報專訊】新型腸出血性大腸桿菌（EHEC）在歐美各國先後爆發，在歐洲最少已造成19人死亡。今次迅速破解EHEC基因之謎的，深圳的華大基因研究院。研究院人員昨接受本報專訪時表示，他們只花了3天時間便初步完成這款新型大腸桿菌的基因排序，發現該菌至少對3種主要抗生素類型有抗藥性，毒性亦非常強。研究員希望在3天後研發出針對的治療措施，有效控制疫情蔓延。
9 S: Q, x B! |6 R% x民營的深圳華大基因研究院曾在2003年SARS期間，成功以一星期時間迅速排列出SARS病毒基因排序，幫助開發出病毒疫苗。今次歐美12國爆發腸出血性大腸桿菌疫情，研究院再成為破譯及幫助應對這次疫情的主要成員。
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; o& p0 A5 I1 D5.39.217.76分析成果上載 國際共用" A% q2 }& {8 r; O! _# M
「華大基因」市場部總監楊碧澄博士透露，德國疫情爆發後，德方專家求助華大基因在歐洲的研究員，研究院在5月23日從德國漢堡大學醫學院得到大腸桿菌樣品，花了3天時間即初步完成了基因組測序和分析，該院更把成果上載到公共數據庫，讓各國研究員和機構共享成果。公仔箱論壇% x% _6 @. z* F
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病菌結構複雜 合用藥物少& f, v9 b. }: p( l2 n+ q9 a A
她透露，華大基因今次迅速成立專組，利用先進的第三代測序儀，對病菌進行測序和生物信息學分析，「團隊發現該菌株是一種新型，兼具侵襲、產毒、腸出血等特徵的大腸桿菌」。她說，該病菌結構奇怪複雜，有多種致病基因融合一起，「很多基因似乎是來自大腸桿菌，因而具有導致腸出血的能力」，治療亦比較困難。研究又發現，該菌株攜有氨基糖甙類、大環內酯類、磺胺類等抗生素的抗藥基因，由於這些抗生素都是常用於治療腸胃感染的第一線藥物，導致合用的治療藥物種類更少。
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正測試快速診斷試劑
& Z% V! z1 ]5 v: N9 d5.39.217.76世衛專家昨日亦表示，導致今次疫潮的大腸桿菌很罕見，過去雖然曾有在人類身上發現的個案，但從未試過爆發。楊碧澄說，目前仍未知此大腸桿菌的來源，不能排除此菌曾長期存在，只是不為人知。他們經過對比基因圖庫，發現這種大腸桿菌與2002年從非洲中部愛滋病患者腹瀉樣本中分離的腸侵襲性大腸桿菌株有96%相似，是與另一種大腸桿菌出現基因變異變成的新品種。
& }) S# ~( M7 D6 a) [5.39.217.76該院會繼續研究，通過對基因序列了解該病菌的特性，期望3天後可以找出針對診斷、監測等方案。「我們在研發快速診斷試劑，現正作測試，希望用來測出食物和病人體內是否有這種病菌。」5.39.217.76. E. h2 y+ K8 v
「研究院的合作伙伴可以通過此成果，應用到臨牀上，研製出有效的藥物和採取預防措施。希望愈快愈好。」tvb now,tvbnow,bttvb& Z) n$ D3 T3 f; |
明報記者 李泉 深圳報道
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2011-06-04
% Y, w1 P4 X Y5.39.217.76【明報專訊】位於深圳的華大基因研究院，有多達180部基因排序機，論DNA排序能力是全球之冠。研究院有4000人員，單是基因排序，便有300名研究員。路透社報道，自SARS以來，中國在病毒研究上取得了迅速發展，研究院獲市政府大力支持，除收取官方撥款，該研究院還會向企業和個人提供DNA排序和其他研究服務，賺到的錢會用於研究發展。tvb now,tvbnow,bttvb4 ^! Y( B( ~( U v
華大基因市場部總監楊碧澄博士表示，今次研究與德國漢堡大學醫學院、中國疾控中心和軍事醫學科學院微生物流行病研究所聯合進行。漢堡是本次疫情的發源地，漢堡大學主要從事臨牀研究，中方則負責分析致病菌基因組。
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發表於 2011-6-4 11:02 AM
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